Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms