Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TFIP11Q9UBB9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms