Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9Q9P2J2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9Q9P2J2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms