Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HCN3Q9P1Z3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms