Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ6

COQ3, Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ3Q9NZJ6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COQ3Q9NZJ6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms