Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS1Q9NYS0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS1Q9NYS0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms