Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZDHHC3Q9NYG2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms