Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CWC25Q9NXE8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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