Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNPOQ9NVS9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPOQ9NVS9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms