Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms