Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDP1Q9NUW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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