Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms