Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms