Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms