Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPJQ9HC77 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms