Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms