Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFDQ9GZP0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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