Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms