Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms