Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms