Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms