Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms