Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms