Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FYCO1Q9BQS8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FYCO1Q9BQS8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms