Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP9Q99956 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms