Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms