Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD27Q96NW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms