Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NBPF4Q96M43 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms