Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms