Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH8Q96L42 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms