Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIC2Q96JB3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms