Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms