Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAJA4Q8WW22 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms