Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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C15orf40Q8WUR7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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C15orf40Q8WUR7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C15orf40Q8WUR7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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