Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL2Q8NHH9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms