Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMER3Q8N944 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms