Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD2Q8IV50 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms