Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME9Q86XW9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms