Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD163Q86VB7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms