Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms