Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD54Q6NXT1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms