Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms