Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms