Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM208BQ5VWN6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms