Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF20Q5VT98 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF20Q5VT98 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PRAMEF20Q5VT98 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PRAMEF20Q5VT98 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PRAMEF20Q5VT98 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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