Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3CQ5T2N8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms