Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms