Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNT1Q5JUK3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms