Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
WDR44Q5JSH3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
WDR44Q5JSH3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms