Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms